管理体系

架构：工程研究中心实行理事会领导下的主任负责制；技术委员会把握技术研究方向、评估技术研究方案，为中心发展运行提供智力和决策支持

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模式：下设四个研究室，各研究室均采用“首席专家＋团队”的组织管理模式，分工明确，高效协作

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理念：以“创新、协调、绿色、开放、共享”为发展管理理念

理事会

作为工程研究中心的决策机构，主要职责是：指定理事会章程；审定中心的研究方向、决策规划、年度计划；聘任中心主任， 并对其进行考核；审定年度经费预算和决策；审定中心各项计划任务完成情况；审定中心的主要规章制度和重点改革决策；对中心的有关重大事项进行决策。

技术委员会

负责中心科研计划的审议，并根据计划确定年度课题，同时对科研学术活动予以指导。 中心主任负责中心的日常管理工作，执行理事会各项决策。中心主任和技术委员会由依托单位提名，理事会聘任。

中心主任及副主任

中心主任负责工程中心的全面工作。 中心副主任负责实验室科研、开发、人才培养、对外交流、产业化等、人事管理和人员培训事务。

工程技术部

自主研发开发并注重吸纳依托单位和国内外相关领域的先进技术、科研成果以及承担国家相关研究发展计划项目和社会委托的研发项目，在本中心进行工程化设计和研究开发，指定相应的工艺、技术规范以及质量标准，为工程化验证提供技术保证。 工程技术部包括4个研究室：

①大数据安全密码工程研究室
②数据可信验证与安全传输研究室
③大数据安全存储与隐私保护研究室
④大数据驱动的智能安全分析研究室

产品测试部

负责对研制的高性能密码卡与云密码机、多源异构数据的跨域可信验证与安全传输系统、 大数据安全存储与挖掘系统、大数据智能安全分析系统进行功能、性能及安全性的测试， 以检测所设计和研发的产品是否满足设计的目标和要求。

成果管理部

负责对中心科研成果的评审、鉴定、验收、应用、推广工作进行计划、组织、指挥、监督、协调，负责中心知识产权的授权和转化等工作。

经营计划部

负责从事市场需要调查研究和市场开拓工作，争取企业委托和政府计划的合同项目，进行新技术、新材料、新产品的应用推广和工程化成熟技术的转化、中心产品的经营，生产企业的技术咨询、技术服务等。